Entre 1998 i 2009 Edmon Colomer ha estat titular de les orquestres del Vallès, de Balears, de Picardie i de Daejeon i principal director convidat a l’Eastern Music Festival dels Estats Units.
Amb les orquestres Jove Orquestra Nacional d’Espanya, Simfònica de Barcelona i Nacional de Catalunya, English Chamber Orchestra, London Sinfonietta, Orchestre de Picardie i els cors Radio France i BBC enregistra per a la ràdio i la televisió d’Europa, d’Amèrica del Nord i del Sud, d’Austràlia, de Corea del Sud i del Japó i també per als segells discogràfics Auvidis-Naïve, Assai, Harmonia Mundi, Calliope, Triton, Ensayo, Virgin i Philips.
Atlántida i El amor brujo de Falla, La Peste de Gerhard, Concert per orgue i Sinfonietta de Poulenc i les produccions audiovisuals de Trencanous de Txaikovski/Béjart i El Concierto de Aranjuez amb Paco de Lucía es consideren avui versions de referència en un ampli catàleg que també inclou obres de Beethoven, Schumann, Fauré, Ginastera, Guinjoan, Honegger, Milhaud, Weill, Bernstein, Nillni i Lavista.
Convençut del component educatiu i social de la música, l’any 1983 va crear la Jove Orquestra Nacional d’Espanya (JONDE) i sovint ha vinculat la seva activitat professional a l’educació. El 2002 el Ministeri de Cultura francès el va nomenar "Chevalier dans l’ordre des palmes académiques".